Tripos力场中的原子类型
C.3 sp3杂化的碳
C.2 sp2杂化的碳
C.ar 芳香碳
C.1 sp杂化的碳
N.3 sp3杂化的氮
N.2 sp2杂化的氮
N.1 sp杂化的氮
O.3 sp3杂化的氧
O.2 sp2杂化的氧
S.3 sp3杂化的硫
N.ar 芳香氮
P.3 sp3杂化的硫
S.2 sp2杂化的
N.pl3 平面三角氮
LP 孤对电子
Du 哑原子
Du.C 具有碳原子质量的哑原子
Si silicon
N.am 氨基氮
S.o 亚砜硫
S.o2 砜硫
N.4 sp3杂化的四配位氮
O.co2 羧酸或磷酸集团中的氧
C.cat 阳离子碳,只在胍基中使用
H.spc SPC水中的氢
O.spc SPC水中的氧
H.t3p TIP3P水中的氢
O.t3p TIP3P水中的氧
ANY 任何原子
HEV 非氢重原子
HET 杂原子 (N, O, S, P)
HAL 卤原子
Cr.oh 水合铬
Cr.th 铬
C.2 sp2杂化的碳
C.ar 芳香碳
C.1 sp杂化的碳
N.3 sp3杂化的氮
N.2 sp2杂化的氮
N.1 sp杂化的氮
O.3 sp3杂化的氧
O.2 sp2杂化的氧
S.3 sp3杂化的硫
N.ar 芳香氮
P.3 sp3杂化的硫
S.2 sp2杂化的
N.pl3 平面三角氮
LP 孤对电子
Du 哑原子
Du.C 具有碳原子质量的哑原子
Si silicon
N.am 氨基氮
S.o 亚砜硫
S.o2 砜硫
N.4 sp3杂化的四配位氮
O.co2 羧酸或磷酸集团中的氧
C.cat 阳离子碳,只在胍基中使用
H.spc SPC水中的氢
O.spc SPC水中的氧
H.t3p TIP3P水中的氢
O.t3p TIP3P水中的氧
ANY 任何原子
HEV 非氢重原子
HET 杂原子 (N, O, S, P)
HAL 卤原子
Cr.oh 水合铬
Cr.th 铬
评论
不是啊
(2008-05-26 21:48:24)