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  • Tripos力场中的原子类型

    2008-04-24 | Tag：分子模拟 分子力场 原子类型

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    http://snowyowls.blogbus.com/logs/19670607.html

            C.3     sp3杂化的碳
            C.2     sp2杂化的碳
            C.ar    芳香碳
            C.1     sp杂化的碳
            N.3     sp3杂化的氮
            N.2     sp2杂化的氮
            N.1     sp杂化的氮
            O.3     sp3杂化的氧
            O.2     sp2杂化的氧
            S.3     sp3杂化的硫
            N.ar    芳香氮
            P.3     sp3杂化的硫
            S.2     sp2杂化的
            N.pl3   平面三角氮
            LP      孤对电子
            Du      哑原子
            Du.C    具有碳原子质量的哑原子
            Si      硅 
            N.am    氨基氮
            S.o     亚砜硫
            S.o2    砜硫
            N.4     sp3杂化的四配位氮
            O.co2   羧酸或磷酸集团中的氧
            C.cat   阳离子碳，只在胍基中使用
            H.spc   SPC水中的氢
            O.spc   SPC水中的氧
            H.t3p   TIP3P水中的氢
            O.t3p   TIP3P水中的氧
            ANY     任何原子
            HEV     非氢重原子
            HET     杂原子 (N, O, S, P)
            HAL     卤原子
            Cr.oh   水合铬
            Cr.th   铬


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    发表于14:51:32 | 编辑 | 继续话题 | 转发 | 分享　0

    评论

  • 博主难道是学生化的么@@
    回复azalea说：
    不是啊
    2008-05-26 21:48:24
    azalea | 发表于2008-05-01 04:04:36 [回复]