相空间

        C.3     sp3杂化的碳
        C.2     sp2杂化的碳
        C.ar    芳香碳
        C.1     sp杂化的碳
        N.3     sp3杂化的氮
        N.2     sp2杂化的氮
        N.1     sp杂化的氮
        O.3     sp3杂化的氧
        O.2     sp2杂化的氧
        S.3     sp3杂化的硫
        N.ar    芳香氮
        P.3     sp3杂化的硫
        S.2     sp2杂化的
        N.pl3   平面三角氮
        LP      孤对电子
        Du      哑原子
        Du.C    具有碳原子质量的哑原子
        Si      silicon
        N.am    氨基氮
        S.o     亚砜硫
        S.o2    砜硫
        N.4     sp3杂化的四配位氮
        O.co2   羧酸或磷酸集团中的氧
        C.cat   阳离子碳，只在胍基中使用
        H.spc   SPC水中的氢
        O.spc   SPC水中的氧
        H.t3p   TIP3P水中的氢
        O.t3p   TIP3P水中的氧
        ANY     任何原子
        HEV     非氢重原子
        HET     杂原子 (N, O, S, P)
        HAL     卤原子
        Cr.oh   水合铬
        Cr.th   铬